Les missions confiées par l’Etat au Parc amazonien de Guyane sont celles qui incombent aux parcs nationaux de France, avec quelques adaptations liées aux contextes géographique et socioculturel guyanais.
En plus des missions classiquement dévolues aux parcs nationaux, le PAG s’est vu confier la mission « de contribuer au développement des communautés d’habitants qui tirent traditionnellement leurs moyens de subsistance de la forêt, en prenant en compte leur mode de vie traditionnel et de participer à un ensemble de réalisations et d’améliorations d’ordre social, économique et culturel dans le cadre du projet de développement durable défini par la charte du parc national » (article L331-15-5 du Code de l’environnement).