Le projet « Petites Masses d’Eau » est un travail d’adaptation des bio-indicateurs des pays européens à la biodiversité de Guyane. En 2010, ce projet a été initié afin de pouvoir disposer d’outils adaptés et conformes aux normes européennes pour mesurer la qualité des cours d’eau. Afin de pourvoir au manque d’outils d’évaluation, les organismes gestionnaires guyanais des milieux naturels (DEAL, PAG, ONF) et les organismes de recherche privée (Hydréco) et publique (Université de Toulouse, INRA Rennes, Université de Bordeaux, ONEMA) ont collaboré autour de deux thèses ayant pour but de créer des indices de qualité des rivières guyanaises, basés sur les populations de poissons et d’invertébrés aquatiques.

Il s’est achevé en 2015, par une restitution aux partenaires et gestionnaires.